Als Bertus gaat bouwen is er geen houden aan. Het ene na het andere object wordt van zand, lijm, glas, gips en vele andere materialen gemetseld.
De bouwwerken ontstaan in de laatste vijftien jaar van zijn leven en zijn een apotheose. De materialenkennis uit zijn huisschildersbestaan komt van pas. De huisjes zien we terug in de vroege schilderijen. In zijn abstracte periode ontwikkelt hij de materialen en structuren die nu de gevels vormen. De symboliek uit de boeken vindt een driedimensionale vorm. Een bootje met een dobbelsteen; een lange rij lege koffertjes; een groot schip dat kleine bootjes vervoert.

Plein 2000

In 1990 wordt zijn Stad van Overgave tentoongesteld. Een bonte verzameling van huisjes, flats, tempels, boten en piramides. De stad wordt aangekocht door het Centraal Museum in Utrecht.
In 2000 wordt de stad in het Dr. Guislainmuseum in Gent tentoongesteld in het kader van het Keizer-Kareljaar. Bertus bouwt de stad daar eigenhandig op.

Schip De Nicolai

Hij maakt meerdere meterlange schepen die weer kleinere bootjes vervoeren. Hij kopieert bestaande gebouwen o.a. Museum De Stadshof in Zwolle dat u hieronder afgebeeld ziet.

Museum De Stadshof

Na zijn dood in 2001 laat Jonkers zijn werk na aan De Stadshof. Stichting Collectie De Stadshof beheert de internationale collectie naieve en outsiderkunst die tot 2000 een plaats had in museum De Stadshof in Zwolle. Sinds 2002 heeft de collectie onderdak gevonden in het Dr. Guislainmuseum in Gent. Hetzelfde museum dat eerder de Stad van Overgave tentoonstelde en waar nu dus weer veel werk van Jonkers te zien is.